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Identifizierung von Mikroorganismen


Methode:
Schnelle molekularbiologische Identifizierung von unbekannten Bakterien, Hefen & Schimmelpilzen mittels Sequenzanalyse

Erwartete Analysedauer: 5 - 7 Werktage

 

 

Service No. Service Typ Beschreibung
MIS_001 Bakterien - Identifizierung Teil 16S rDNS Amplifizierung und Sequenzierung eines Teilstücks des 16S rRNS Gens (500-800 bp). Die erhaltenen Sequenzen werden in öffentlichen Datenbanken verglichen und die Ähnlichkeitswerte zu den nächst verwandten Arten werden ausgewiesen.
MIS_002 Bakterien - Identifizierung Gesamt 16S rDNS Amplifizierung und Sequenzierung des 16S rRNS Gens (ca. 1400 bp). Die erhaltenen Sequenzen werden in öffentlichen Datenbanken verglichen und die Ähnlichkeitswertse zu den nächst verwandten Arten werden ausgewiesen.
MIS_003 Hefe - Identifizierung Teil 26S rDNS Amplifizierung und Sequenzierung eines Teilstücks des 26S rRNS Gens (D1/D2 Region). Die erhaltenen Sequenzen werden in öffentlichen Datenbanken verglichen und die Ähnlichkeitswerte zu den nächst verwandten Arten werden ausgewiesen.
MIS_004 Hefe - Identifizierung Gesamt 18S rDNS Amplifizierung und Sequenzierung des 18S rRNS Gens. Die erhaltenen Sequenzen werden in öffentlichen Datenbanken verglichen und die Ähnlichkeitswerte zu den nächst verwandten Arten werden ausgewiesen.
MIS_005 Schimmelpilz - Identifizierung Teil 26S rDNS Amplifizierung und Sequenzierung eines Teilstücks des 26S rRNS Gens (D1/D2 Region). Die erhaltenen Sequenzen werden in öffentlichen Datenbanken verglichen und die Ähnlichkeitswerte zu den nächst verwandten Arten werden ausgewiesen.
MIS_006 Phylogenetische Analyse der
rDNS Sequenzen
Phylogenetischer
Baum
Die Topologie des Konsensusbaums wird mittels Neighbour-> Joining, Maximum Parsimony und Maximum Likelihood- Verfahren an verschiedenen Datensets evaluiert.

Bitte spezifizieren Sie im Probenbegleitformular, ob die eingesendeten Kulturen auf Bakterien, Hefen oder Schimmelpilze hin untersucht werden sollen. Das MIS kann nur an Reinkulturen durchgeführt werden. Bitte beachten Sie dabei, dass die vermicon AG nur biologisches Material der BIO Sicherheitsstufen I und II akzeptieren kann.

         

Reinkulturen:

Anreicherungsbouillon (10 ml) oder Agarplatte mit Kolonien

         

Andere:

       
  DNS: Hochmolekulare, gereinigte DNS.
  Mischkulturen / Umweltproben Isolierung und Reinigung der Proben kann gegen Aufschlag durchgeführt werden. Bitte fordern Sie ein Angebot für diesen Service an.
         

 

 

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